Zwei Jahre, nachdem sie sich bei ihrem letzten Fall zerkriegt haben, werden die Dänische Dogge Scooby-Doo und seine menschlichen Kollegen Fred, Daphne, Shaggy und Velma erneut als Detektive engagiert. Im Ferienclub Spooky Island gehen seltsame Dinge vor sich und Besitzer Emile Mondavarious fürchtet um seine Besucherzahlen. Nachdem sich das Team von Mystery Inc. wieder zusammengerauft hat, macht es sich sogleich daran, die mysteriösen Vorfälle mit Monstern, Zombies und anderen düsteren Wesen aufzuklären.